本研究利用ISSR和EST-SSR標(biāo)記對中國13個、日本4個與肯尼亞5個茶樹品種的遺傳多樣性進(jìn)行分析,重點(diǎn)比較了ISSR和EST-SSR在多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)、引物解析能力、多態(tài)性信息含量和標(biāo)記系數(shù)等方面的差異。結(jié)果表明在位點(diǎn)檢測能力上ISSR明顯高于EST-SSR,每條ISSR引物可檢測的平均條帶數(shù)(12.5)比每對EST-SSR引物(3.1)高三倍。ISSR標(biāo)記的Rp值是EST-SSR標(biāo)記的6.3倍,其多態(tài)性信息含量(PIC)和標(biāo)記系數(shù)(MI)也明顯高于EST-SSR,這表明ISSR具較高的多態(tài)性位點(diǎn)檢測能力和較高的標(biāo)記效率。EST-SSR揭示的Nei基因多樣性(H=0.28)高于ISSR(0.21),這種差異進(jìn)而會影響到遺傳距離和聚類分析的結(jié)果。在檢測中國、日本和肯尼亞茶樹品種的遺傳差異上,兩種標(biāo)記表現(xiàn)出較一致的趨勢,中國茶樹品種在多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)量、Nei基因多樣性、遺傳距離上均大于日本和肯尼亞的茶樹品種。研究還表明,由于EST-SSR可檢測到等位位點(diǎn)的變異,它比ISSR可以更準(zhǔn)確地反映和揭示供試品種的遺傳多樣性水平。同時由于單個EST-SSR標(biāo)記檢測到的位點(diǎn)數(shù)量較ISSR標(biāo)記少,且特異性較強(qiáng),譜帶較易分辨,因此比ISSR標(biāo)記更適用于對大量樣本的分析。
完成機(jī)構(gòu):[1]中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所、國家茶樹改良中心,杭州310008 [2]浙江大學(xué)茶葉研究所,杭州310029